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Devinez qui je suis ?

(@alnus-fanatique)
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Bonjour Ă  tous les supermicrobiologistes 😄

Je rentre de congĂ© et je dois ĂȘtre un peu rouillĂ©, ou alors c'est cette chaleur qui me ramolli le cerveau... j'ai un problĂšme d'identification de contaminant... Vous allez certainement pouvoir m'aider a rĂ©flĂ©chir...

Plusieurs colonies se sont dĂ©veloppĂ©es sur la gĂ©lose sabouraud avec chloramphĂ©nicol (5 jours d'incubation Ă  22,5'C) mais quand je fais un Gram sur les colonies elles ressemblent Ă  des coques gram positif Ă  si mĂ©prendre 🤔, alors que ce mĂȘme contaminant ne pousse pas sur trypcase soja 😨

Le test aminopeptidase est négatif.

L'aspect microscopique est plus gros qu'une spore de moisissure et plus petit qu'une levure, ça ressemble vraiment à des coques G+

🤯 Je sĂšche... Vous en pensez quoi ?

 

 

 
Posté : 22/08/2023 6:17 pm
 kath
(@kath)
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Bonjour

Ce qui m'a interpellĂ© Ă  votre demande , c'est une bactĂ©rie qui pousse sur Malt et non sur TCS, nous avions eu cette mĂȘme problĂ©matique nous l'avions identifiĂ©e comme Ă©tant un Gluconobacter sp. 

 

Bonne journĂ©e 🤔 

 
Posté : 25/08/2023 11:47 am
(@alnus-fanatique)
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Bonjour Ă  tous,

Alors je suis de retour avec mon contaminant mystere ... je suis toujours dans l'inconnu 😓 

J'ai envoyé mon contaminant dans un labo equipé Vitek MS et Vitek compact ... et bien c'est choux blanc aussi de leur coté ! Merci Kath pour la proposition mais malheuresement le Gluconobacter sort sur Vitek MS ... en conséquence ca ne semble pas etre ça 

Leur conclusion a été faite sur une observation microscopique au final soit : "Staphylococcus et apparentés"

 

Bien que ça me rassure un poil sur mes capacités à la paillasse, ça ne m'aide pas vraiment ! J'ai donc grand besoin de tous les Supermicrobiologistes pour m'aider à identifier ce contaminant...

Il a été isolé depuis un produit liquide (type sirop peu sucré)

Se developpe bien sur gélose Sabouraud+Chlorampenicol (5 jours-22,5°C)

Observation microscopique : (plutot) Coque

Aminopeptidase négative : Gram positif

Non identifiable sur Vitek MS/compact

 

J'ai besoin de vous ... HELP

 
Posté : 15/09/2023 10:18 am
(@mandm)
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Bonjour, avez-vous pensĂ© une autre mĂ©thode d’identification ?

Toutes ont leurs forces et leurs faiblesses et ne se recoupent pas tout le temps.

Je pensais par exemple à BioLog, phénotypique et avec une technologie différente de Vitek. Pas besoin de sélection selon le Gram, ce qui limite les possibles biais.

Sinon, il reste un séquençage.

 

Pour TSA, avez-vous tenté sur 2 boites en incubant à 20-25°C et 30-35°C ?

Il y a des contaminants environnementaux qui peuvent mettre plus de 2 semaines Ă  produire une colonie visible.

 
Posté : 15/09/2023 12:26 pm
pierre reacted
(@alnus-fanatique)
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Ah nan j'ai pas du tout pensé à essayer la TSA à 20-25°C, j'essaye ca dÚs lundi ... merci du tuyau

Je ne suis pas equipé biolog mais je vais voir si je peux envoyer ca chez un sous traitant ... merci aussi pour ça.

Le sĂ©quençage j'y ai pensĂ© mais c'etait plutot ma derniere option envisageable (rapport Ă  mon argumentation pour mon patron 😉 )

 
Posté : 15/09/2023 4:37 pm
pierre reacted
(@alnus-fanatique)
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Me revoilĂ  avec mon enigme ...

Sur les conseils de MandM j'ai lancé 2 boites TSA en incubant à 20-25°C et 30-35°C  , résultat la boite à 20-25°C a fini par pousser !

La catalase est trÚs faiblement positive également.

 

Voilà donc les caractéristiques à aujourd'hui :

Isolé depuis un produit liquide (type sirop peu sucré)

Se developpe bien sur gélose Sabouraud+Chlorampenicol (5 jours-22,5°C)

Se developpe sur gélose TSA (lentement) à 22,5°C = toutes petites colonies blanc cremes lisses régulieres et bombées non muqueuses

Observation microscopique : (plutot) Coque

Aminopeptidase négative : Gram positif

Catalase faiblement positive

Non identifiable sur Vitek MS/compact

 

Et malheuresement j'ai n'ai pas rĂ©ussi Ă  avoir le feu vert pour l'envoyer dans un labo equipĂ© avec Biolog ou en sequençage 😓 

 
Posté : 24/09/2023 9:48 am
pierre reacted
(@microbio-cosmebac)
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Bonjour,

Pourrions nous avoir une photo macroscopique des colonies et si possible une image de la coloration de Gram ? Vos indications sur les croissances ainsi que sur les aspects macroscopiques pourraient indiquer des levures (certitude sur le Gram ?). Vous pouvez mĂȘme valider une levure juste en ouvrant la boite pour sentir cette odeur caractĂ©ristique ...

Curieux de voir la suite.

 
Posté : 27/09/2023 9:14 pm
pierre reacted
 ACE
(@ace)
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Bonjour, 

Peut-ĂȘtre que vous pourriez envoyer vos colonies Ă  un laboratoire possĂ©dant un MALDI TOF ? 

 

 
Posté : 27/09/2023 10:44 pm
pierre reacted
(@alnus-fanatique)
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@ace bonsoir, le maldi tof a déjà été tenté sur vitek ms et ça n'a rien donné malheureusement

 
Posté : 27/09/2023 11:41 pm
pierre reacted
(@alnus-fanatique)
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@microbio-cosmebac pas de soucis pour les photos je m'en occupe demain.

L'identification sur une levure a également été ma premiÚre intention mais le Gram ne me permet pas de conclure la dessus... ce qui a été confirmé par le labo extérieur puisque eux s'oriente sur Staphylococcus et apparentés... 

NĂ©anmoins je vous posterai une photo demain pour avoir vos avis aussi 😉

 
Posté : 27/09/2023 11:45 pm
(@alnus-fanatique)
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Chose promise, chose due ... voilĂ  les photos du coquin qui m'embete

 

 
Posté : 28/09/2023 9:08 pm
(@alnus-fanatique)
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La gélose SABC en gros plan

 
Posté : 28/09/2023 9:09 pm
(@alnus-fanatique)
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et le Gram

 
Posté : 28/09/2023 9:10 pm
(@microbio-cosmebac)
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Sur la photo du Gram, la taille est trop importante selon moi pour ĂȘtre des coques. De plus, l'aspect macroscopique des colonies sur la gĂ©lose Sabouraud me conforte vraiment sur des levures. 

Je ne vous donnerai pas de certitude à 100% mais c'est trÚs probable. En espérant connaßtre le fin mot de l'histoire.

Microbiologiquement !

Antoine

 
Posté : 28/09/2023 10:00 pm
pierre reacted
(@alnus-fanatique)
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@microbio-cosmebac la mesure au microscope est de 0.92 Ă  0.96 microns ... ca me parait bien petit pour des levures quand mĂȘme...  je ne suis pas specialiste en levures mais il me semblait que c'etait beaucoup plus gros. J'en ai jamais vu et eu de si petite en tous cas 🤔

 
Posté : 29/09/2023 8:34 am

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