Glossaire des E.coli produisant des shigatoxines (STEC)
En écrivant nos articles sur les STEC on s’est vite rendu compte qu’il y avait beaucoup de sigles et d’acronymes. Même nous on s’y perdait !
On a donc décidé de construire un glossaire et comme on n’aime pas garder les choses pour nous, le voici (classé par ordre alphabétique).
Pour aller plus loin dans les STEC :
- Détection des STEC dans les aliments
- Pourquoi la détection des STEC dans les aliments est-elle si compliquée ?
- Guide d’achat STEC: Quelle méthode pour détecter les E.coli producteurs de shigatoxines ?
Découvrez les 5 meilleures PCR pour la détection des STEC
Nous avons sondé les SuperMicrobiologistes.
Voici les 5 PCR STEC préférées
AEEC : Les Attaching and Effacing Escherichia coli sont des souches d’E. coli possédant le gène eae qui code pour l’Intimine (une protéine qui permet l’adhésion de la bactérie aux cellules épithéliales de l’intestin). Souche isolée d’un aliment.
Big five (on retrouve également l’expression TOP 5) : 5 sérotypes d’E.coli suivants : O157:H7, O26:H11, O145:H28, O103:H2 et O111:H8
Big Seven (on retrouve également l’expression TOP 7) : 7 sérotypes d’E.coli suivants : O157:H7, O26:H11, O145:H28, O103:H2, O111:H8, O45:H2 et O121 H19
DAEC : Diffusely Adherent Escherichia coli. Souche d’E.coli produisant de l’adhésine afimbriale (gene afa). Souche isolée chez un patient malade
eae : gène codant pour l’Intimine (protéine permettant l’adhésion de la bactérie à l’intestin)
EAEC : Entéroagrégatifs Escherichia coli. Souche isolée chez un patient malade
EIEC : Entéroinvasifs Escherichia coli. Souche isolée chez un patient malade
EHEC : Enterohemorrhagic Escherichia coli. C’est la dénomination utilisée pour les souches isolées chez un patient malade. Les Escherichia coli entérohémorragiques constituent un sous-groupe des STEC, ce sont les souches de STEC pathogènes pour l’Homme.
EHEC atypiques : EHEC possédant le gène stx isolée chez un patient malade = STEC.
EHEC typiques : EHEC possédant les gènes stx et eae isolée chez les patients = STEC pathogènes.
EHEC typiques majeurs : EHEC possédant les gènes stx et eae et faisant partie d’un des sérotypes top 5. C’est une souche isolée chez un patient malade = STEC HP (Hautement Pathogène)
EPEC : EntéroPathogènes Escherichia coli, isolé de patients équivalent AEEC, possède le gène stx.
ETEC : Les Escherichia coli entérotoxinogènes. Souche isolée chez un patient malade.
Sérotype : sérogroupe + antigène flagellaire H
Sérogroupe : L’antigène somatique O
STEC : Souches d’E.coli produisant des shigatoxines. Les Shigatoxines sont codées par les gènes stx.
STEC pathogène : Souche de E.coli possédant les gènes stx + aea
STEC HP (hautement pathogène) : Souche de E.coli possédant les gènes stx, eae et faisant partie du TOP 5 (sérotype du Top 5) O157:H7, O26:H11, O145:H28, O103:H2 et O111:H8
stx: gènes codant pour les Shigatoxines. Il existe plusieurs gènes stx (stx1, stx2, stx 2c/d stx2e/f
VTEC : Verotoxin-producing E. coli ancienne dénomination des STEC
vtx : gène codant pour les Vérotoxine (ancien nom des Shigatoxines)
SHU : Syndrome Hémolytique et Urémique. C’est une maladie infectieuse pouvant être causée par les STEC.
Vous en voyez d’autres ? Venez nous le dire.
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